Sejak tahun 2014, UIN Suska Riau telah memperoleh sertifikat Quality Management System – ISO 9001:2008 yang dikeluarkan oleh BSI Group. Saat ini UIN Suska Riau telah memperoleh sertifikat ISO 9001:2015,  standar internasional yang digunakan untuk menetapkan kebijakan dan sasaran mutu (quality objective) serta pencapaiannya. ISO 9001:2015 mencakup 10 klausul, yaitu: Ruang lingkup, Rujukan normatif, Istilah dan definisi, Konteks organisasi, Kepemimpinan, Perencanaan, Dukungan, Operasional, Evaluasi kinerja, dan Peningkatan performa.